百邁客已有十年科技服務(wù)經(jīng)驗,在十年的成長(cháng)道路上,為越來(lái)越多的轉錄組測序項目提供驗證實(shí)驗服務(wù),轉錄組+qPCR定量驗證已成為科學(xué)研究的常見(jiàn)技術(shù)。
百邁客秉承“持續創(chuàng )新、追求卓越、客戶(hù)至上、拼搏奮進(jìn)、團結協(xié)作”的核心價(jià)值觀(guān),十年科研服務(wù)經(jīng)驗,致力于打通基因測序與結果驗證,給客戶(hù)提供更全面的科研服務(wù)?;谑昕品?jīng)驗和qPCR技術(shù)團隊實(shí)驗經(jīng)驗,正式推出試劑盒產(chǎn)品Biomarker 2X SYBR Green Fast qPCR Mix,用于高通量測序結果的基因驗證。
新品上市,怎么能沒(méi)有活動(dòng)呢?接好啦~~

活動(dòng)內容
轉錄組滿(mǎn)12個(gè)樣品,免費贈送qPCR試劑盒,高達500次反應/盒。
活動(dòng)時(shí)間:2020年3月份
活動(dòng)要求:
1、三月份完成簽單和送樣;
2、贈送試劑盒待項目結題后,由所在地區區域經(jīng)理負責配送;
3、文章發(fā)表時(shí),需注明轉錄組測序分析及qPCR試劑盒由百邁客提供,見(jiàn)刊后提供全文。
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案例分享
英文題目:Global transcriptomic analysis of zebrafish in response to embryonic exposure to three antidepressants, amitriptyline, fluoxetine and mianserin
中文題目:轉錄組分析斑馬魚(yú)胚胎暴露于三種抗抑郁藥(阿米替林,氟西汀和米安色林)的應答機理
發(fā)表雜志:Aquatic Toxicology
影響因子:4.129
合作單位:上海大學(xué)環(huán)境與化學(xué)工程學(xué)院
研究背景
人用和獸用藥物是一種新興的有機污染物,首次發(fā)現是在20世紀70年代的時(shí)候,在污水流出物中檢測出。藥物的生產(chǎn)和發(fā)展旨在治愈疾病、改善人類(lèi)健康,但由于過(guò)量或過(guò)期藥物的隨意排放,同時(shí)廢水處理廠(chǎng)(WWTPs)對大多數藥物殘留的去除較為低效,所以低濃度藥物及其分解產(chǎn)物仍然廣泛分布在水生系統中。
抗抑郁藥是全球治療焦慮、恐慌癥和抑郁癥最常用的藥物。它們也是水生環(huán)境中最常檢測到的藥物。已有研究表明,多種抗抑郁藥物在水生環(huán)境及水生生物中積累,抗抑郁藥物可能會(huì )影響水生生物的繁殖能力、生存、生長(cháng)、捕食和學(xué)習行為,但是抗抑郁藥物影響水生生物的作用機制仍然難以明確。
作者為了更好地了解不同種類(lèi)抗抑郁藥誘導的毒性反應在非靶向魚(yú)類(lèi)中的作用機制,用分屬于不同抗抑郁藥物類(lèi)別的阿米替林(Amitriptyline hydrochloride)、氟西?。‵luoxetine hydrochloride)和鹽酸米安色林(mianserin hydrochloride)對早期發(fā)育階段的斑馬魚(yú)胚胎進(jìn)行處理,然后進(jìn)行了轉錄組測序(RNA-Seq),基于前面轉錄組的分析結果,作者采取兩組qPCR驗證實(shí)驗:
1.?DEG表達模式驗證
作者根據RNA- seq結果選取了15個(gè)基因(4個(gè)上調、11個(gè)下調),用qPCR驗證其表達模式。結果表明,qPCR結果與RNA-Seq結果相似(圖3A~C)。此外,通過(guò)線(xiàn)性擬合和皮爾遜相關(guān)性方法分析了RNA-Seq和qPCR的結果間的相關(guān)性,結果表明兩種方法的分析結果呈顯著(zhù)正相關(guān)(圖3D~F)。

2.不同濃度的抗抑郁藥物處理下DEG的應答反應
作者用三種不同濃度的抗抑郁藥(0.1、1和10 μg /L)處理斑馬魚(yú)胚胎,應用qPCR試驗確定6個(gè)選定的基因的濃度—應答關(guān)系。結果表明,ptgdsb的mRNA水平只在1 μg /L阿米替林和10 μg /L米安色林處理組顯著(zhù)降低;而dusp5表達水平在10 μg /L阿米替林和米安色林處理組以及所有氟西汀處理組中均顯著(zhù)降低;除了在1和10 μg /L阿米替林處理組中的nr1d1表達水平未受抑制之外,nr1d1和per2在幾乎所有抗抑郁藥物處理組均受到顯著(zhù)抑制。此外,兩個(gè)與早期生長(cháng)應答相關(guān)的基因egr1和egr4在0.1和10 μg /L阿米替林處理組和所有米安色林處理組中表達下調,egr4在所有氟西汀處理組降低,而egr1只在0.1和10 μg /L氟西汀處理組中表達降低(圖4)。

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