時(shí)空組學(xué)研究前沿進(jìn)展【第4期】

空間轉錄組助力果蠅抗腫瘤機制研究

期刊：PNAS

IF：9.8

時(shí)間：2023年7月

全文：http://m.runyoushoujike.com/wp-content/uploads/2023/08/20230725-pans-g.pdf

研究將10x空間轉錄組技術(shù)應用于研究果蠅的抗腫瘤反應過(guò)程，報道了果蠅中一個(gè)名為mt//1的G蛋白偶聯(lián)蛋白，作為潛在的腫瘤識別受體，介導了機體抑制腫瘤細胞增殖的新的天然免疫反應。其中空間轉錄組測序分析工作由北京百邁客助力完成！

基于熒光圖像數據的單細胞多組學(xué)數據庫

期刊：Nucleic Acids Research

IF：14.9

時(shí)間：2023年7月

全文：http://m.runyoushoujike.com/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file.pdf

作者開(kāi)發(fā)了基于圖像的單細胞多組學(xué)數據庫的綜合瀏覽器——iSMOD。該數據庫整合了多個(gè)數據庫中的物種、基因、蛋白、細胞種類(lèi)、細胞marker、蛋白探針的信息和原位技術(shù)為主的圖像數據。并提供了一個(gè)用戶(hù)友好型的交互式平臺。

單細胞轉錄組解析油菜素內酯介導的基因調控網(wǎng)絡(luò )

期刊： Science

IF：56.9

時(shí)間：2023年3月

全文：http://m.runyoushoujike.com/wp-content/uploads/2023/08/pdf.pdf

研究對不同發(fā)育時(shí)期的擬南芥的根進(jìn)行了單細胞轉錄組測序。 單細胞和皮層軌跡實(shí)驗結果表明了根皮層相關(guān)基因是響應油菜素內酯的目標基因。進(jìn)一步從基因調控網(wǎng)絡(luò )中鑒定出響應油菜素內酯和調控細胞伸長(cháng)的關(guān)鍵基因，揭示了油菜素內酯信號的時(shí)空調節模式。