時(shí)空組學(xué)研究前沿進(jìn)展【第6期】

亞細胞級別分辨率的細胞分割算法

期刊： Nature Methods

IF：48

時(shí)間：2023年7月

全文：http://m.runyoushoujike.com/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-4.pdf

作者開(kāi)發(fā)了命名為亞細胞空轉細胞分割技術(shù)的算法：SCS。該算法相比其他分割算法更為準確地識別每個(gè)細胞的位置，并能標注其細胞類(lèi)型。還能進(jìn)一步提供有關(guān)細胞內RNA分子的亞細胞定位的信息。從而使研究人員能夠深入探究細胞在組織內的活動(dòng)。

單細胞技術(shù)解析靈長(cháng)類(lèi)脊髓損傷修復機制

期刊：Nature Communication

IF：16.6

時(shí)間：2023年8月

全文：http://m.runyoushoujike.com/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-5.pdf

作者通過(guò)對構建的胸段全橫斷脊髓損傷恒河猴模型進(jìn)行了單細胞轉錄組測序，深入解析了完全性脊髓損傷近端和遠端不同區域的細胞動(dòng)態(tài)變化。并進(jìn)一步研究了膠原材料支架移植對完全性脊髓損傷不同區域的治療效應和機制。

同時(shí)檢測轉錄水平與Hi-C的單細胞多組學(xué)技術(shù)

期刊：Nature Structural & Molecular Biology

IF：16.8

時(shí)間：2023年8月

全文：http://m.runyoushoujike.com/wp-content/uploads/2023/08/hicmrna.pdf

作者建立了能實(shí)現了在單個(gè)細胞中同時(shí)檢測染色質(zhì)三維結構（Hi-C）和轉錄表達的單細胞多組學(xué)技術(shù)方法——scCARE-seq。并利用小鼠胚胎干細胞中驗證了該方法的效果。結果表明，此方法優(yōu)化了單細胞Hi-C聚類(lèi)結果，矯正了細胞周期的干擾，進(jìn)一步促進(jìn)Hi-C與轉錄之間動(dòng)態(tài)調控關(guān)系的研究。